Com a mudança do novo Ensino Médio a partir da base nacional comum curricular (BNCC), foi definida uma nova organização curricular flexível e interdisciplinar. Além dos componentes curriculares da formação geral básica, o Ábaco oferece em sua matriz um conjunto de programas acadêmicos modulados de acordo com os interesses dos estudantes, permitindo-lhes certa autonomia na escolha desses programas. Dentro de cada área do conhecimento, os professores aprofundam, em abordagem inter e multidisciplinar, temas que são tratados com metodologias diferenciadas ligadas às unidades curriculares de oficina, laboratórios, aulas extracurriculares, eletivas, núcleos de estudo e de criação artística.